RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.55■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.54■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 TOM1O60784 492 aa27.53■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 DCCP43146 1447 aa27.51■■■□□ 2
HOXD11-201ENST00000249504 ATF3P18847 181 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 USP47Q96K76 1375 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
HOXD11-201ENST00000249504 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO41Q8TF61 875 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRB2O60241 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 PIP4K2BP78356 416 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 SLAIN2Q9P270 581 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
HOXD11-201ENST00000249504 MST1RQ04912 1400 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 NUTM2FA1L443 756 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD11-201ENST00000249504 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
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HOXD11-201ENST00000249504 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 TESK2Q96S53 571 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 CDK19Q9BWU1 502 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 EVC2Q86UK5 1308 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXD11-201ENST00000249504 USP32Q8NFA0 1604 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 BRINP3Q76B58 766 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ORAI2Q96SN7 254 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ITSN1Q15811 1721 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ATP7BP35670 1465 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 KIF1AQ12756 1690 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 SLC24A1O60721 1099 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 CABP2Q9NPB3 220 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD11-201ENST00000249504 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 PHLPP1O60346 1717 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 HSPA1LP34931 641 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 TMF1P82094 1093 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.15■■□□□ 1.94
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HOXD11-201ENST00000249504 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 FOXO3O43524 673 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD11-201ENST00000249504 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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HOXD11-201ENST00000249504 CCDC7Q96M83 1385 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 CDCA8Q53HL2 280 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 CABP1Q9NZU7 370 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 PSME1Q06323 249 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 PXDNQ92626 1479 aa27.04■■□□□ 1.92
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HOXD11-201ENST00000249504 ACEP12821 1306 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 TMC1Q8TDI8 760 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD11-201ENST00000249504 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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HOXD11-201ENST00000249504 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 JCADQ9P266 1359 aa26.97■■□□□ 1.91
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HOXD11-201ENST00000249504 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 SHPRHQ149N8 1683 aa26.95■■□□□ 1.91
HOXD11-201ENST00000249504 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 SBNO1A3KN83 1393 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 USP6P35125 1406 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.91■■□□□ 1.9
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