RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 NEUROD2Q15784 382 aa26.69■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.68■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.68■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 SYNMO15061 1565 aa26.67■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 SMC5Q8IY18 1101 aa26.66■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 NGEFQ8N5V2 710 aa26.66■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 TERF1P54274 439 aa26.64■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.862e-6■■□□□ 13.1
ODC1-201ENST00000234111 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
ODC1-201ENST00000234111 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.63■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 SNX21Q969T3 373 aa26.62■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 ARID3AQ99856 593 aa26.62■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 MAP7D2Q96T17 732 aa26.62■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.62■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 CDCA8Q53HL2 280 aa26.61■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 PTMSP20962 102 aa26.59■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.58■■□□□ 1.85
ODC1-201ENST00000234111 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.57■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 UQCRHP07919 91 aa26.57■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.56■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 SSFA2P28290 1259 aa26.55■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 MYOM1P52179 1685 aa26.55■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.52■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.52■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ODC1-201ENST00000234111 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 IQGAP1P46940 1657 aa26.5■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.5■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.5■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.5■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.49■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 KIF2CQ99661 725 aa26.49■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.48■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 HS1BP3Q53T59 392 aa26.47■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 RUNDC1Q96C34 613 aa26.47■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.47■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 WDR63Q8IWG1 891 aa26.45■■□□□ 1.83
ODC1-201ENST00000234111 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 ATP10BO94823 1461 aa26.44■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.44■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 UNC13BO14795 1591 aa26.43■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 ZNF445P59923 1031 aa26.43■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 SHROOM2Q13796 1616 aa26.43■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 DYNC1I1O14576 645 aa26.43■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 RBSNQ9H1K0 784 aa26.43■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.42■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 MADDQ8WXG6 1647 aa26.42■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.42■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 ABCA8O94911 1581 aa26.42■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.42■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.41■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 LNPKQ9C0E8 428 aa26.41■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.41■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa26.4■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 TRIM27P14373 513 aa26.4■■□□□ 1.82
ODC1-201ENST00000234111 MCTP1Q6DN14 999 aa26.39■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 ATP10AO60312 1499 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 SHPRHQ149N8 1683 aa26.37■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.36■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.36■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 CEP152O94986 1710 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 NUCB1Q02818 461 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.35■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 KANK1Q14678 1352 aa26.34■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 AK9Q5TCS8 1911 aa26.33■■□□□ 1.81
ODC1-201ENST00000234111 CCDC27Q2M243 656 aa26.32■■□□□ 1.8
ODC1-201ENST00000234111 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms