RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 TAF3Q5VWG9 929 aa12.29□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.29□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.29□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 SPC24Q8NBT2 197 aa12.29□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.29□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 RABEP1Q15276 862 aa12.28□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 SYNJ1O43426 1573 aa12.28□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 TIAM1Q13009 1591 aa12.28□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 TRIM29Q14134 588 aa12.28□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 CCDC27Q2M243 656 aa12.28□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.28□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 CPLX1O14810 134 aa12.27□□□□□ -0.44
TTL-201ENST00000233336 PRDM10Q9NQV6 1147 aa12.27□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 MCM4P33991 863 aa12.27□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 NCOA2Q15596 1464 aa12.27□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 COG3Q96JB2 828 aa12.26□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 ZMYND15Q9H091 742 aa12.26□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.26□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.26□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 NECTIN2Q92692 538 aa12.26□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.26□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 PDILTQ8N807 584 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 LEKR1Q6ZMV7 388 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 MPNDQ8N594 471 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 ARAP1Q96P48 1450 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 PDE3AQ14432 1141 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 NEK4P51957 841 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 ERICH4A6NGS2 130 aa12.25□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 MARCH6O60337 910 aa12.24□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 FIBPO43427 364 aa12.24□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 OLFM4Q6UX06 510 aa12.24□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 SDF4Q9BRK5 362 aa12.24□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 MCM2P49736 904 aa12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 SMC2O95347 1197 aa12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 KINO60870 393 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 PLCD4Q9BRC7 762 aa12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 ERC2O15083 957 aa12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 VPS53Q5VIR6 699 aa12.23□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 NUTM2FA1L443 756 aa12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 BCAR3O75815 825 aa12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 GNAI1P63096 354 aa12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 DEF6Q9H4E7 631 aa12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 ZSCAN30Q86W11 494 aa12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 CAGE1Q8TC20 777 aa12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.22□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 PDCP20941 246 aa12.21□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.21□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa12.21□□□□□ -0.45
TTL-201ENST00000233336 CCP110O43303 1012 aa12.21□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 PPP2R1AP30153 589 aa12.21□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.21□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 TTLL5Q6EMB2 1281 aa12.21□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CCDC192P0DO97 292 aa12.21□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.21□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CCDC184Q52MB2 194 aa12.21□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 HMOX1P09601 288 aa12.21□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CCDC112Q8NEF3 446 aa12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CFTRP13569 1480 aa12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 TRDNQ13061 729 aa12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 SKIDA1Q1XH10 827 aa12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 TSPYL1Q9H0U9 437 aa12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 PSMA5P28066 241 aa12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.19□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 TCP11L2Q8N4U5 519 aa12.19□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 TEFQ10587 303 aa12.19□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 NFXL1Q6ZNB6 911 aa12.19□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CNTROBQ8N137 903 aa12.19□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 HECW1Q76N89 1606 aa12.19□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 FMNL2Q96PY5 1086 aa12.18□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CDR1P51861 262 aa12.18□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 PRM3Q9NNZ6 103 aa12.18□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.18□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 TNMDQ9H2S6 317 aa12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms