RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 PDE3AQ14432 1141 aa29.5■■■□□ 2.31
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ANKRD54-201ENST00000215941 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.48■■■□□ 2.31
ANKRD54-201ENST00000215941 AAMPQ13685 434 aa29.47■■■□□ 2.31
ANKRD54-201ENST00000215941 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.47■■■□□ 2.31
ANKRD54-201ENST00000215941 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
ANKRD54-201ENST00000215941 ZMYM3Q14202 1370 aa29.47■■■□□ 2.31
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ANKRD54-201ENST00000215941 USP19O94966 1318 aa29.36■■■□□ 2.29
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ANKRD54-201ENST00000215941 BCAR3O75815 825 aa29.34■■■□□ 2.29
ANKRD54-201ENST00000215941 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.34■■■□□ 2.29
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ANKRD54-201ENST00000215941 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.32■■■□□ 2.28
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ANKRD54-201ENST00000215941 ERVK-7P63135 1459 aa29.31■■■□□ 2.28
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ANKRD54-201ENST00000215941 WWC1Q8IX03 1113 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-201ENST00000215941 REREQ9P2R6 1566 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-201ENST00000215941 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.23■■■□□ 2.27
ANKRD54-201ENST00000215941 IDI1Q13907 227 aa29.23■■■□□ 2.27
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ANKRD54-201ENST00000215941 SEC24BO95487 1268 aa29.13■■■□□ 2.25
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.13■■■□□ 2.25
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.13■■■□□ 2.25
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ANKRD54-201ENST00000215941 ZFYVE9O95405 1425 aa29.12■■■□□ 2.25
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ANKRD54-201ENST00000215941 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.01■■■□□ 2.23
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ANKRD54-201ENST00000215941 ADGRB2O60241 1585 aa28.98■■■□□ 2.23
ANKRD54-201ENST00000215941 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-201ENST00000215941 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-201ENST00000215941 NSD2O96028 1365 aa28.97■■■□□ 2.23
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