RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.47■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.47■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.46■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 MYOM1P52179 1685 aa24.46■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
USP18-201ENST00000215794 CDCA8Q53HL2 280 aa24.42■■□□□ 1.5
USP18-201ENST00000215794 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
USP18-201ENST00000215794 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
USP18-201ENST00000215794 NUDCQ9Y266 331 aa24.37■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.37■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.37■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 MED14O60244 1454 aa24.37■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 PTPRUQ92729 1446 aa24.35■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.34■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 PRAM1Q96QH2 718 aa24.33■■□□□ 1.49
USP18-201ENST00000215794 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.32■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 TBX22Q9Y458 520 aa24.32■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.3■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 STRCQ7RTU9 1775 aa24.29■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.29■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.29■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 PPP2R1AP30153 589 aa24.28■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 POGKQ9P215 609 aa24.28■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.27■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 DIP2AQ14689 1571 aa24.27■■□□□ 1.48
USP18-201ENST00000215794 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 ABCC11Q96J66 1382 aa24.26■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 SLC24A1O60721 1099 aa24.26■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 KCNA6P17658 529 aa24.25■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.25■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.23■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.22■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.22■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.21■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 CPS1P31327 1500 aa24.21■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 DLC1Q96QB1 1528 aa24.2■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.2■■□□□ 1.47
USP18-201ENST00000215794 TECPR2O15040 1411 aa24.2■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.19■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 INSRP06213 1382 aa24.19■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.18■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.16■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 CABP2Q9NPB3 220 aa24.16■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.15■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.14■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 PIK3R4Q99570 1358 aa24.14■■□□□ 1.46
USP18-201ENST00000215794 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.14■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.13■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 PTCH1Q13635 1447 aa24.12■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
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USP18-201ENST00000215794 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 NUTM2FA1L443 756 aa24.11■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 PDE3BQ13370 1112 aa24.11■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 EVC2Q86UK5 1308 aa24.1■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 CDK19Q9BWU1 502 aa24.1■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 SIRT1Q96EB6 747 aa24.08■■□□□ 1.45
USP18-201ENST00000215794 NWD1Q149M9 1564 aa24.07■■□□□ 1.44
USP18-201ENST00000215794 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.05■■□□□ 1.44
USP18-201ENST00000215794 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
USP18-201ENST00000215794 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
USP18-201ENST00000215794 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.03■■□□□ 1.44
USP18-201ENST00000215794 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
USP18-201ENST00000215794 C14orf37Q86TY3 774 aa24.02■■□□□ 1.44
USP18-201ENST00000215794 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.02■■□□□ 1.44
USP18-201ENST00000215794 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 USP32Q8NFA0 1604 aa23.99■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.99■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 MORC1Q86VD1 984 aa23.99■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 ADGRB2O60241 1585 aa23.98■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 TMEM94Q12767 1356 aa23.98■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.97■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 ZNF521Q96K83 1311 aa23.95■■□□□ 1.43
USP18-201ENST00000215794 CABP1Q9NZU7 370 aa23.95■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.95■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.94■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.94■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 ATP7BP35670 1465 aa23.94■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.93■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 SHPRHQ149N8 1683 aa23.93■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.92■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 APAF1O14727 1248 aa23.92■■□□□ 1.42
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