RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-211ENST00000626236 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.97□□□□□ -0.97
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SGMS1-211ENST00000626236 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.95□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.95□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.95□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 MON1BQ7L1V2 547 aa8.95□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 FBXO32Q969P5 355 aa8.95□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF653Q96CK0 615 aa8.95□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM11Q96F44 468 aa8.95□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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