RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 BIRC3Q13489 604 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 NCOA4Q13772 614 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ZNF699Q32M78 642 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 EML3Q32P44 896 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 PMS2CLQ68D20 193 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1958Q8N8K9 716 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ATP2A3Q93084 1043 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ADAM33Q9BZ11 813 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TMEM9BQ9NQ34 198 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa23.44■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 A8MXQ7 604 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 GIPC1O14908 333 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 PHACTR2O75167 634 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 VNN1O95497 513 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 HDCP19113 662 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 SYKP43405 635 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ZACNQ401N2 412 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TSTD1Q8NFU3 115 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TMC2Q8TDI7 906 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 WASF3Q9UPY6 502 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 MAPK13O15264 365 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 RHOBTB3O94955 611 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 CEACAM1P13688 526 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 IFNAR2P48551 515 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 NDUFA8P51970 172 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 DGKEP52429 567 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 SLC7A9P82251 487 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ZXDBP98169 803 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 BAHCC1Q9P281 2608 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PQ27 194 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PQ64 194 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PQD8 194 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 DLG4P78352 724 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 NFIL3Q16649 462 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 CYP2U1Q7Z449 544 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 SDCBP2Q9H190 292 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ATP8B3O60423 1300 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 MYH10P35580 1976 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 CLDN5O00501 218 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 IKBKBO14920 756 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 PRR29P0C7W0 189 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 CDH8P55286 799 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 DPYDQ12882 1025 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TAF10Q12962 218 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 NR1H3Q13133 447 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 FAM35AQ86V20 835 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TNIP3Q96KP6 325 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.4■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 ABCA7Q8IZY2 2146 aa23.39■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 LAMA1P25391 3075 aa23.39■■□□□ 1.34
SRRT-218ENST00000620394 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 LEFTY2O00292 366 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 KIF20AO95235 890 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 RASSF3Q86WH2 238 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 NUP93Q8N1F7 819 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 TAF4BQ92750 862 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 TPSD1Q9BZJ3 242 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 IL37Q9NZH6 218 aa23.39■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 NFATC1O95644 943 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 P4HA1P13674 534 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 ENPEPQ07075 957 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 SV2AQ7L0J3 742 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 TTC16Q8NEE8 873 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 RNF38Q9H0F5 515 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 IGF2RP11717 2491 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 ATRXP46100 2492 aa23.38■■□□□ 1.33
SRRT-218ENST00000620394 FAM92AA1XBS5 289 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms