RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	NCKAP1L	P55160	1127 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	AMPD2	Q01433	879 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	BATF3	Q9NR55	127 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.77	□□□□□ -0.52
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCC6	O95255	1503 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NNMT	P40261	264 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	KLC1	Q07866	573 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	KAT5	Q92993	513 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PORCN	Q9H237	461 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	GPR182	O15218	404 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MYO1D	O94832	1006 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	UBOX5	O94941	541 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	FBXO21	O94952	628 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ADCY3	O60266	1144 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SHBG	P04278	402 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PAEP	P09466	180 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MYBL2	P10244	700 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	INSRR	P14616	1297 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MED21	Q13503	144 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	GANC	Q8TET4	914 aa		11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	AKAP10	O43572	662 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SLURP2	P0DP57	97 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	THPO	P40225	353 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PPAT	Q06203	517 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	YY1AP1	Q9H869	796 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TBC1D12	O60347	775 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RGS2	P41220	211 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CYTH1	Q15438	398 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CALB2	P22676	271 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SERPINB5	P36952	375 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CNTN2	Q02246	1040 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	DSG1	Q02413	1049 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RCN1	Q15293	331 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	APBB2	Q92870	758 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms