RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SCML4	Q8N228	414 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	GMIP	Q9P107	970 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667		E7ENQ6	273 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	AKR1B10	O60218	316 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	RTN2	O75298	545 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	MOSPD3	O75425	235 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ZBED1	O96006	694 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CSH1	P0DML2	217 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CSH2	P0DML3	217 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	LCP1	P13796	627 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	RRM1	P23921	792 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	NTHL1	P78549	312 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	TAF5	Q15542	800 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	POTEH	Q6S545	545 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ST7	Q9NRC1	585 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	NCK2	O43639	380 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	FBXO21	O94952	628 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	GJB6	O95452	261 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	F11	P03951	625 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	FYN	P06241	537 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	YWHAQ	P27348	245 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ACADSB	P45954	432 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	TAF10	Q12962	218 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	MIS12	Q9H081	205 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DNMT1-208	ENST00000586667	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms