RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHAMP1Q96JM3 812 aa29.94■■■□□ 2.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRT82Q9NSB4 513 aa29.94■■■□□ 2.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HPSEQ9Y251 543 aa29.94■■■□□ 2.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 K7EQS6 105 aa29.93■■■□□ 2.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CALUO43852 315 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HECTD3Q5T447 861 aa29.92■■■□□ 2.38
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCSER2Q9H7U1 834 aa29.91■■■□□ 2.38
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANTXRLA6NF34 631 aa29.9■■■□□ 2.38
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KAT7O95251 611 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KDSRQ06136 332 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MESP2Q0VG99 397 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLA2G2CQ5R387 149 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LY6G5CQ5SRR4 150 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TTC30AQ86WT1 665 aa29.87■■■□□ 2.37
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