RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 ZMIZ2Q8NF64 920 aa24.08■■□□□ 1.45
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PPP4C-212ENST00000567828 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-212ENST00000567828 TWNKQ96RR1 684 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-212ENST00000567828 CFAP97Q9P2B7 532 aa24.08■■□□□ 1.45
PPP4C-212ENST00000567828 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
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PPP4C-212ENST00000567828 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.07■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 USP18Q9UMW8 372 aa24.06■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.05■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 OPRD1P41143 372 aa24.05■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 TGM1P22735 817 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 PRCPP42785 496 aa24.04■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 CEP68Q76N32 757 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 COMMD8Q9NX08 183 aa24.04■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 SEMA4DQ92854 862 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 RMND1Q9NWS8 449 aa24.03■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 CILPO75339 1184 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 RETP07949 1114 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 TUBP50607 506 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 SEC13P55735 322 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4C-212ENST00000567828 NUCB2P80303 420 aa24.02■■□□□ 1.44
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PPP4C-212ENST00000567828 NUP205Q92621 2012 aa24.01■■□□□ 1.43
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PPP4C-212ENST00000567828 CETN3O15182 167 aa24.01■■□□□ 1.43
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PPP4C-212ENST00000567828 THADAQ6YHU6 1953 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa24■■□□□ 1.43
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PPP4C-212ENST00000567828 HHLA1C9JL84 531 aa24■■□□□ 1.43
PPP4C-212ENST00000567828 K7EQS6 105 aa24■■□□□ 1.43
PPP4C-212ENST00000567828 CYP26A1O43174 497 aa24■■□□□ 1.43
PPP4C-212ENST00000567828 RPP40O75818 363 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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