RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBXL6Q8N531 539 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 SHC3Q92529 594 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 SIX2Q9NPC8 291 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP3Q9Y6I4 520 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.14■■□□□ 1.14
ADAMTS17-205ENST00000558960 TCF3P15923 654 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLA2G4AP47712 749 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 BPIFB4P59827 614 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC7A9P82251 487 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 PTK2Q05397 1052 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 UBA3Q8TBC4 463 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 TFAP2BQ92481 460 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 NACA2Q9H009 215 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 GMIPQ9P107 970 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 TECTAO75443 2155 aa22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 GLULP15104 373 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 GNA15P30679 374 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 MEA1Q16626 185 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 RAB41Q5JT25 222 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 M0QYV0 167 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAN2B1O00754 1011 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 THAP12O43422 761 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 OLFM2O95897 454 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 RALAP11233 206 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 CLCN5P51795 746 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 TKTL1P51854 596 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 STARD6P59095 220 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 APBA1Q02410 837 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 UBXN1Q04323 297 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 PKDCCQ504Y2 493 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 FLCNQ8NFG4 579 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 MSANTD3Q96H12 275 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 HSFY1Q96LI6 401 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC22A12Q96S37 553 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 RNF38Q9H0F5 515 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCL26Q9Y258 94 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 KRBA1A5PL33 1030 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 LGALS16A8MUM7 142 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 UCHL3P15374 230 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 MTF1Q14872 753 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 PDGFRLQ15198 375 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF276Q8N554 614 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 NELL2Q99435 816 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 STK33Q9BYT3 514 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 GKN1Q9NS71 199 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 NAGPAQ9UK23 515 aa22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 CYP26A1O43174 497 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 COCHO43405 550 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 TLR5O60602 858 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 OBSL1O75147 1896 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZBED1O96006 694 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF77Q15935 545 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-205ENST00000558960 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms