RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 MAP3K7CLP57077 242 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FBXO43Q4G163 708 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 HECTD3Q5T447 861 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 KRT39Q6A163 491 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 LONP2Q86WA8 852 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 C12orf29Q8N999 325 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TWNKQ96RR1 684 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TSG101Q99816 390 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FAM92AA1XBS5 289 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 RNF40O75150 1001 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 BEST1O76090 585 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FAM200BP0CF97 657 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ADORA2BP29275 332 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CNR2P34972 360 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ID4P47928 161 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 MXI1P50539 228 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SPATA20Q8TB22 786 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SMARCE1Q969G3 411 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TIGD1Q96MW7 591 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 GMIPQ9P107 970 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FRYLO94915 3013 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 COCHO43405 550 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 HRO43593 1189 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 STX10O60499 249 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CILPO75339 1184 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CD58P19256 250 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 HOXC13P31276 330 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TUBP50607 506 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 LPAL2Q16609 132 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 WHAMMQ8TF30 809 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SEMA4DQ92854 862 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 EML5Q05BV3 1969 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 E2F8A0AVK6 867 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CYP17A1P05093 508 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 OPRD1P41143 372 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 DHCR24Q15392 516 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 GAB4Q2WGN9 574 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 RAB20Q9NX57 234 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 HHLA1C9JL84 531 aa14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TLR5O60602 858 aa14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 LRRC63Q05C16 580 aa14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 STIM1Q13586 685 aa14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF394Q53GI3 561 aa14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 CEP68Q76N32 757 aa14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PCNX4-209ENST00000555569 TTC39CQ8N584 583 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms