RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SOBPA7XYQ1 873 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 F8VP50 259 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 F8VZ95 297 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 M0QYV0 167 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 O00370 1275 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 CYP26A1O43174 497 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 HCRTO43612 131 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SOAT2O75908 522 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 NOL4O94818 638 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 FERP16591 822 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 PFKLP17858 780 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ATF6P18850 670 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 YWHAQP27348 245 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ZNF132P52740 706 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GUCA2AQ02747 115 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SFMBT2Q5VUG0 894 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GJB7Q6PEY0 223 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SARM1Q6SZW1 724 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 MTSS1LQ765P7 747 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TADA2BQ86TJ2 420 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 VPS36Q86VN1 386 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 FAM71AQ8IYT1 594 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 UBR7Q8N806 425 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GIPC2Q8TF65 315 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SUSD6Q92537 303 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 KAT5Q92993 513 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 MYRFLQ96LU7 910 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TWNKQ96RR1 684 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GANQ9H2C0 597 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SYNCQ9H7C4 482 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GDE1Q9NZC3 331 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TSPAN16Q9UKR8 245 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TEX33O43247 280 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GFPT2O94808 682 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 FBXO21O94952 628 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 VNN2O95498 520 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ABL1P00519 1130 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 RALAP11233 206 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 CYP11B1P15538 503 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 DESP17661 470 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GABRR2P28476 465 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 AVPR1AP37288 418 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 PLA2G4AP47712 749 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GPR15P49685 360 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 KLK7P49862 253 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 CDR1P51861 262 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SLC5A3P53794 718 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 EPHA5P54756 1037 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 JAM2P57087 298 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 SH3BP2P78314 561 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ZBED6P86452 979 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 TFF2Q03403 129 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ARID5AQ03989 594 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 ASIC2Q16515 512 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-210ENST00000547912 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms