RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SETSIPP0DME0 302 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CD19P15391 556 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 GJA1P17302 382 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 NPR3P17342 541 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CD58P19256 250 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FCARP24071 287 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CNR2P34972 360 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 ASPAP45381 313 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G4AP47712 749 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CXCL12P48061 93 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FMO5P49326 533 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC5A3P53794 718 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 BCAT1P54687 386 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH8P55286 799 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 WNT7BP56706 349 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DLG4P78352 724 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC7A9P82251 487 aa5.92□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 DMWDQ09019 674 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF10Q12962 218 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MTF1Q14872 753 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM35AQ86V20 835 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 OSTM1Q86WC4 334 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 DCLK2Q8N568 766 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC16Q8NEE8 873 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 TAS1R2Q8TE23 839 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDN23Q96B33 292 aa5.92□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 MIS12Q9H081 205 aa5.92□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 CTNND2Q9UQB3 1225 aa5.92□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.91□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 PES1O00541 588 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 ATP2C2O75185 946 aa5.91□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 CHKAP35790 457 aa5.91□□□□□ -1.46
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CLSTN3-215ENST00000544584 PPP3CAQ08209 521 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 BST2Q10589 180 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNH2Q12809 1159 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 MTA1Q13330 715 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CUL2Q13617 745 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-215ENST00000544584 CAMK4Q16566 473 aa5.91□□□□□ -1.46
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