RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA1-208	ENST00000529524	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA1-208	ENST00000529524	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMA1-208	ENST00000529524	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMA1-208	ENST00000529524	CUX2	O14529	1486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	UBXN7	O94888	489 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	PRF1	P14222	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	NPR1	P16066	1061 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CREB1	P16220	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CCKBR	P32239	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	BCAT1	P54687	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	LMAN2	Q12907	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	EPHA3	P29320	983 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	INSC	Q1MX18	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524		H3BML4	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524		H3BNX3	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	RASSF9	O75901	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC7A1	P30825	629 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CCKAR	P32238	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	DIO1	P49895	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ARFIP2	P53365	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ITGA8	P53708	1063 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ID2	Q02363	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TWIST1	Q15672	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524		M0R3H8	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ABLIM3	O94929	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	UQCRC1	P31930	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	PIM3	Q86V86	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	MYB	P10242	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ME1	P48163	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TIRAP	P58753	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	LINC00205	P59089	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	KCNB1	Q14721	858 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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