RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	HACE1	Q8IYU2	909 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	MCU	Q8NE86	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CCT6B	Q92526	530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	HSPH1	Q92598	858 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	MCM3AP	O60318	1980 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999		A8MXQ7	604 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RASA4B	C9J798	803 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	APOL1	O14791	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RASA4	O43374	803 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SNX3	O60493	162 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RECQL4	O94761	1208 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SUN1	O94901	812 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ETS1	P14921	441 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	IL4R	P24394	825 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	STX2	P32856	288 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RGS2	P41220	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TAF6	P49848	677 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	BCAR1	P56945	870 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	GPR162	Q16538	588 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TLK2	Q86UE8	772 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	APPL2	Q8NEU8	664 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	EVPL	Q92817	2033 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999		H7C0C1	242 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	HUS1	O60921	280 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	GCAT	O75600	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ZWINT	O95229	277 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CD48	P09326	243 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	GCA	P28676	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ATP5O	P48047	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	AIF1	P55008	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	DYNLT1	P63172	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	NKX3-2	P78367	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PDE4C	Q08493	712 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ORC1	Q13415	861 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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