RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TBC1D17Q9HA65 648 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 NMUR1Q9HB89 426 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ACP6Q9NPH0 428 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CYP26A1O43174 497 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 COCHO43405 550 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ABL1P00519 1130 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CKMP06732 381 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TCF3P15923 654 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CD72P21854 359 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CLCN5P51795 746 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 MFAP3P55082 362 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TNK2Q07912 1038 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 FLCNQ8NFG4 579 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 SH3RF2Q8TEC5 729 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 SHC3Q92529 594 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 VPS16Q9H269 839 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 GKN1Q9NS71 199 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TBX18O95935 607 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 COL9A1P20849 921 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TUBP50607 506 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 BCAT1P54687 386 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 PRKCQQ04759 706 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 USP4Q13107 963 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 HECTD3Q5T447 861 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 YAF2Q8IY57 180 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 BPIFA3Q9BQP9 254 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 FOXQ1Q9C009 403 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 HPS4Q9NQG7 708 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 COL4A2P08572 1712 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A1W2PQH9 124 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 LEFTY2O00292 366 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 KRT5P13647 590 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 AOC1P19801 751 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PLA2G4AP47712 749 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 FZD5Q13467 585 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGAP44Q17R89 818 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 TRIM68Q6AZZ1 485 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PM20D1Q6GTS8 502 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PMF1Q6P1K2 205 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 CHFRQ96EP1 664 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 CYLDQ9NQC7 956 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 HESX1Q9UBX0 185 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 CPQQ9Y646 472 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PATJQ8NI35 1801 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 KANSL1LA0AUZ9 987 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 SYCE3A1L190 88 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP1A3P13637 1013 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 GLULP15104 373 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 ARSAP15289 507 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 SOX9P48436 509 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 KLK7P49862 253 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PDE6CP51160 858 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 TKTL1P51854 596 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 PLCB2Q00722 1185 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 MTF1Q14872 753 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 DENND1BQ6P3S1 775 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 TTC8Q8TAM2 541 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF606Q8WXB4 792 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms