RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511145.1

FAM13A-215, Transcript of family with sequence similarity 13 member A, human

TSL 3

Gene FAM13A, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM13A-215	ENST00000511145	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	CFB	P00751	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	FGA	P02671	866 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	RB1	P06400	928 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	ICAM3	P32942	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	NRIP1	P48552	1158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	HSD17B4	P51659	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	MGAT3	Q09327	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	COASY	Q13057	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	LPIN1	Q14693	890 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	PGM5	Q15124	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	CRY1	Q16526	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	TBR1	Q16650	682 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	SUSD6	Q92537	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	LPP	Q93052	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM13A-215	ENST00000511145	EVPL	Q92817	2033 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ENPP3	O14638	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RAMP2	O60895	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	NBL1	P41271	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ALX1	Q15699	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	APBB2	Q92870	758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	P2RX5	Q93086	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	BLACE	A4D250	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CAND2	O75155	1236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	KRT37	O76014	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CD52	P31358	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	ID4	P47928	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SP4	Q02446	784 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	GHRHR	Q02643	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	KCNC3	Q14003	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM13A-215	ENST00000511145	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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