RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF292O60281 2723 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPRDP23468 1912 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OBSL1O75147 1896 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 E2F8A0AVK6 867 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COCHO43405 550 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CILPO75339 1184 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EGFP01133 1207 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R2P41236 205 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FNTBP49356 437 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MXI1P50539 228 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAP3K7CLP57077 242 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC63Q05C16 580 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ORC1Q13415 861 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STIM1Q13586 685 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCLK2Q8N568 766 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OTUB2Q96DC9 234 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB20Q9NX57 234 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYO15AQ9UKN7 3530 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF40O75150 1001 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BEST1O76090 585 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ID4P47928 161 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAMKK1Q8N5S9 505 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GMIPQ9P107 970 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMA7O14818 248 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HRO43593 1189 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD58P19256 250 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADORA2BP29275 332 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOXK2Q01167 660 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHCR24Q15392 516 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WHAMMQ8TF30 809 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEMA4DQ92854 862 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACDQ96AP0 544 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TWNKQ96RR1 684 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NACA2Q9H009 215 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C2orf42Q9NWW7 574 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCML2Q9UQR0 700 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADH1CP00326 375 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP17A1P05093 508 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DMWDQ09019 674 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYT13Q7L8C5 426 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUSP16Q9BY84 665 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CISHQ9NSE2 258 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HHLA1C9JL84 531 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TLR5O60602 858 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRP3O75074 770 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RETP07949 1114 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OPRD1P41143 372 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSEN1P49768 467 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms