RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 GMIPQ9P107 970 aa8.78□□□□□ -1
TSPAN7-208ENST00000494037 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
TSPAN7-208ENST00000494037 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.78□□□□□ -1
TSPAN7-208ENST00000494037 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.78□□□□□ -1
TSPAN7-208ENST00000494037 LAMA1P25391 3075 aa8.78□□□□□ -1
TSPAN7-208ENST00000494037 SPTBN2O15020 2390 aa8.78□□□□□ -1
TSPAN7-208ENST00000494037 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.77□□□□□ -1
TSPAN7-208ENST00000494037 HHLA1C9JL84 531 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 K7ESF4 209 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 BIN1O00499 593 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 PSMA7O14818 248 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 COCHO43405 550 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 EGFP01133 1207 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM200BP0CF97 657 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 PPP3CCP48454 512 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 GAB4Q2WGN9 574 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF394Q53GI3 561 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CPA6Q8N4T0 437 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 TATDN2Q93075 761 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ATP2A3Q93084 1043 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC35C1Q96A29 364 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 RAB20Q9NX57 234 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.77□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CYP26A1O43174 497 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 STX10O60499 249 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 RNF40O75150 1001 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CYP17A1P05093 508 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CXCL12P48061 93 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 TUBP50607 506 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 GALK1P51570 392 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 STIM1Q13586 685 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 MORC3Q14149 939 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 HECTD3Q5T447 861 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 TTI2Q6NXR4 508 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 DCLK2Q8N568 766 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 NELFBQ8WX92 580 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 WBP2Q969T9 261 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 EPC1Q9H2F5 836 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 NMUR1Q9HB89 426 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CISHQ9NSE2 258 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 OSER1Q9NX31 292 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.76□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ANTXRLA6NF34 631 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 TLR5O60602 858 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 NFATC1O95644 943 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 TBX18O95935 607 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 IRF1P10914 325 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 OPRD1P41143 372 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 FMO5P49326 533 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 FNTBP49356 437 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 RAD23BP54727 409 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 STX17P56962 302 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 MESP2Q0VG99 397 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 LRMPQ12912 555 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 CUL2Q13617 745 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 PPP2R5DQ14738 602 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 C12orf40Q86WS4 652 aa8.75□□□□□ -1.01
TSPAN7-208ENST00000494037 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms