RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491569.5

ATP6AP1-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-209ENST00000491569 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 USP18Q9UMW8 372 aa21.55■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 DPYSL4O14531 572 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 RALAP11233 206 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 CAPN2P17655 700 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF280DQ6N043 979 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 PLVAPQ9BX97 442 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 LTBP2Q14767 1821 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZBBXA8MT70 800 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 RARAP10276 462 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SCNN1AP37088 669 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 GRIK1P39086 918 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ACAP1Q15027 740 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 DEFB106AQ8N104 65 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 PRELID2Q8N945 189 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 STKLD1Q8NE28 680 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 TTPALQ9BTX7 342 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.54■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 LRRD1A4D1F6 860 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 E7ENQ6 273 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 RAD51CO43502 376 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 KRT10P13645 584 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 VSNL1P62760 191 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF365Q70YC5 407 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 HSPH1Q92598 858 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 IGSF21Q96ID5 467 aa21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC188H7C350 402 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 FSCN2O14926 492 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 HSF2BPO75031 334 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 PCK1P35558 622 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 GPR15P49685 360 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 DAOAP59103 153 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ADCY2Q08462 1091 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 DCAF6Q58WW2 860 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ODF2Q5BJF6 829 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 KAZNQ674X7 775 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 RCOR2Q8IZ40 523 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 AMACRQ9UHK6 382 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 EFCAB14O75071 495 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 CAPN15O75808 1086 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZBED1O96006 694 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 EPHB4P54760 987 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 HDAC4P56524 1084 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 TBCBQ99426 244 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1-209ENST00000491569 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 OR6C75A6NL08 312 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 FBXO21O94952 628 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 KRT7P08729 469 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 CD48P09326 243 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 CPB1P15086 417 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 SYN1P17600 705 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 MATKP42679 507 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 DDR2Q16832 855 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 ARCQ7LC44 396 aa21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ATP6AP1-209ENST00000491569 YME1L1Q96TA2 773 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms