RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.65■□□□□ 0.9
RPS6KB1-208ENST00000489824 RNF43Q68DV7 783 aa20.65■□□□□ 0.9
RPS6KB1-208ENST00000489824 KCNK16Q96T55 309 aa20.65■□□□□ 0.9
RPS6KB1-208ENST00000489824 KRT82Q9NSB4 513 aa20.65■□□□□ 0.9
RPS6KB1-208ENST00000489824 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.65■□□□□ 0.9
RPS6KB1-208ENST00000489824 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RPS6KB1-208ENST00000489824 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RPS6KB1-208ENST00000489824 E2F8A0AVK6 867 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 COCHO43405 550 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 AP1G2O75843 785 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 KAT7O95251 611 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 STK4Q13043 487 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 GAB4Q2WGN9 574 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 PAGE5Q96GU1 130 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 COMMD8Q9NX08 183 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.64■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TIE1P35590 1138 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRIA2P42262 883 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC6A11P48066 632 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TUBP50607 506 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLDN10P78369 228 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 GAD2Q05329 585 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CRY1Q16526 586 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 EOGTQ5NDL2 527 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CEP135Q66GS9 1140 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 ACOT1Q86TX2 421 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 ALLCQ8N6M5 410 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 OTUB2Q96DC9 234 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 EDEM2Q9BV94 578 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 KLRC4O43908 158 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 NR3C1P04150 777 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 PIK3CAP42336 1068 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 KDSRQ06136 332 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 RASSF3Q86WH2 238 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TAF4BQ92750 862 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TCEAL3Q969E4 200 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SPACA7Q96KW9 195 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 DMAC2Q9NW81 257 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 GMIPQ9P107 970 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 USP25Q9UHP3 1055 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 PTPRDP23468 1912 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDXKO00764 312 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TNFRSF10BO14763 440 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIF20AO95235 890 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 VNN1O95497 513 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 MYL1P05976 194 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 IRF1P10914 325 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC130P13994 396 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TNFRSF4P43489 277 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 DLG4P78352 724 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZACNQ401N2 412 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 PMS2CLQ68D20 193 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 FUKQ8N0W3 1084 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMC2Q8TDI7 906 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 WHAMMQ8TF30 809 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SDCBP2Q9H190 292 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KB1-208ENST00000489824 A0A1B0GVL5 298 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms