RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 C4orf22Q6V702 233 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 DPH6Q7L8W6 267 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 APBB2Q92870 758 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 RNF157Q96PX1 679 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TGDSO95455 350 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 GJB1P08034 283 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NEK3P51956 506 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CCNG1P51959 295 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SNX16P57768 344 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SLC18A2Q05940 514 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MMRN1Q13201 1228 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 BOLA3Q53S33 107 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF484Q5JVG2 852 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CLNKQ7Z7G1 428 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SLC26A11Q86WA9 606 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 UBA3Q8TBC4 463 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SH3TC2Q8TF17 1288 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PEBP4Q96S96 227 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KLC2Q9H0B6 622 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MINDY3Q9H8M7 445 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 APOL1O14791 398 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KRT37O76014 449 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 HAUS5O94927 633 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 LMNAP02545 664 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 GSTA2P09210 222 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 T-ENOLP0DO92 83 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FGFR1P11362 822 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ARFIP2P53365 341 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 RBP5P82980 135 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 INCA1Q0VD86 236 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KCTD2Q14681 263 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NAA25Q14CX7 972 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 C1orf228Q6PIY5 440 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NPNTQ6UXI9 565 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TEKT4Q8WW24 435 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CFAP36Q96G28 342 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 RAB6BQ9NRW1 208 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ERAP1Q9NZ08 941 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 DCTN4Q9UJW0 460 aa16■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 A0A0G2JND7 137 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 SOCS7O14512 581 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 COPEO14579 308 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 KCNN4O15554 427 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CBX6O95503 412 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 C22orf31O95567 290 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZBED1O96006 694 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IL1BP01584 269 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PGK2P07205 417 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 DHRS4L1P0CG22 281 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NDST1P52848 882 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 BCAR1P56945 870 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZBTB16Q05516 673 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FAAP100Q0VG06 881 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 MTM1Q13496 603 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TTLL4Q14679 1199 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ILDR2Q71H61 639 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF276Q8N554 614 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 FAM13CQ8NE31 585 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 USP6NLQ92738 828 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 RTP4Q96DX8 246 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 TBCBQ99426 244 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 EVPLQ92817 2033 aa15.99■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 E5RJQ4 531 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 DPYSL4O14531 572 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC22O60826 627 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PIAS1O75925 651 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 ZBTB7AO95365 584 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 PYGBP11216 843 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 OSBPP22059 807 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 CALB2P22676 271 aa15.98■□□□□ 0.15
C9orf3-218ENST00000482056 OVGP1Q12889 678 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms