RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481804.5

CCDC78-211, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 3,248 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-211ENST00000481804 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PANX3Q96QZ0 392 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 RAD17O75943 681 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 TM7SF2O76062 418 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ARHGAP8P85298 464 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SLC18A2Q05940 514 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 HIC1Q14526 733 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 NPNTQ6UXI9 565 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 RDM1Q8NG50 284 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 VCX3BQ9H321 246 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SPAG6O75602 509 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ABCD1P33897 745 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ENPEPQ07075 957 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SLX4Q8IY92 1834 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 H0YIN7 160 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 APOC2P02655 101 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 CDH6P55285 790 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 MTMR2Q13614 643 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 TAF5Q15542 800 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 MROH9Q5TGP6 573 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 TFAP2BQ92481 460 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 APOL6Q9BWW8 343 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 A0A0B4J269 797 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 KRT38O76015 456 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 MAP3K6O95382 1288 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 APRTP07741 180 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 KRT19P08727 400 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ACTR3P61158 418 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 CDC16Q13042 620 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 IFT43Q96FT9 208 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PLLPQ9Y342 182 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 TSHRP16473 764 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SERPINB6P35237 376 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 RTP1P59025 263 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ACTR2P61160 394 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ASPHQ12797 758 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 MMRN1Q13201 1228 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 STX3Q13277 289 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ORC1Q13415 861 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 RNF146Q9NTX7 359 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 POLIQ9UNA4 740 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 KCNN4O15554 427 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ETS2P15036 469 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 CHRNA5P30532 468 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 ZNF699Q32M78 642 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 XKR3Q5GH77 459 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 C7orf26Q96N11 449 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 A0A1B0GVG6 124 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 YY1P25490 414 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 MIPP30301 263 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC78-211ENST00000481804 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms