RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SCML4Q8N228 414 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 STKLD1Q8NE28 680 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 USP3Q9Y6I4 520 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 HIDE1A8MVS5 230 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CSPG5O95196 566 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 TUBB4AP04350 444 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ATF6P18850 670 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 FLT3P36888 993 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 GPM6BQ13491 265 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 EMC1Q8N766 993 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SPATA17Q96L03 361 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 IL37Q9NZH6 218 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DNAI1Q9UI46 699 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 YIPF1Q9Y548 306 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 EPOPA6NHQ4 379 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DAB1O75553 588 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 GRAP2O75791 330 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 FTCDO95954 541 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ZBED1O96006 694 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 USP17L7P0C7H9 530 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CA8P35219 290 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 USP46P62068 366 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MESDQ14696 234 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 LILRA6Q6PI73 481 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ARCQ7LC44 396 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DAAM2Q86T65 1068 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 IRGQQ8WZA9 623 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CERS4Q9HA82 394 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MAFFQ9ULX9 164 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ALG6Q9Y672 507 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MYO7AQ13402 2215 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 FAM92AA1XBS5 289 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 E7ENQ6 273 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MYO1FO00160 1098 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DPYSL4O14531 572 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 TGM5O43548 720 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PROSCO94903 275 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ADH1AP07327 375 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 GLI1P08151 1106 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MAN1A1P33908 653 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MTMR3Q13615 1198 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PTPROQ16827 1216 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 NUP93Q8N1F7 819 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 GPR152Q8TDT2 470 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 TLR10Q9BXR5 811 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 NCK2O43639 380 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 HSF2BPO75031 334 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 FYNP06241 537 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 GPD1P21695 349 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 COMTP21964 271 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PSMA2P25787 234 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CASQ1P31415 396 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PEX26Q7Z412 305 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SCD5Q86SK9 330 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms