RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 AXLP30530 894 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 GJC1P36383 396 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 GPD2P43304 727 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MAGEA6P43360 314 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ACADSBP45954 432 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 VPS41P49754 854 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ATP11AP98196 1134 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CDK16Q00536 496 aa8.89□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 DPYSL3Q14195 570 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NOMO1Q15155 1222 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TMED2Q15363 201 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.89□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 CCNJLQ8IV13 435 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 PPTC7Q8NI37 304 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 KLHL29Q96CT2 875 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MTBPQ96DY7 904 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 HPDLQ96IR7 371 aa8.89□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.992e-18■□□□□ 8.7
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ACTB-208ENST00000464611 HESX1Q9UBX0 185 aa8.89□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.89□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MDM4O15151 490 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TYROBPO43914 113 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MICAL2O94851 1124 aa8.88□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 RBP3P10745 1247 aa8.88□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 HOXD10P28358 340 aa8.88□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 C2CD6Q53TS8 623 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SPATA18Q8TC71 538 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CPT1BQ92523 772 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NLRP4Q96MN2 994 aa8.88□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 ZNF670Q9BS34 389 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.88□□□□□ -0.99
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ACTB-208ENST00000464611 ECT2Q9H8V3 914 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DPP3Q9NY33 737 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TBK1Q9UHD2 729 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SIX4Q9UIU6 781 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 HACD1B0YJ81 288 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 C2CD2LO14523 706 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 KLF11O14901 512 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 KRT37O76014 449 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 UBOX5O94941 541 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 UNC5CO95185 931 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V1G2O95670 118 aa8.87□□□□□ -0.99
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