RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462721.5

DMKN-222, Transcript of dermokine, human

TSL 1 (best)

Gene DMKN, Length 970 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-222	ENST00000462721	CXCL12	P48061	93 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	FMO5	P49326	533 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	PGF	P49763	221 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	RAD23B	P54727	409 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	STX17	P56962	302 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	USP4	Q13107	963 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	PAK1	Q13153	545 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CCIN	Q13939	588 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	GAS6	Q14393	721 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	EML3	Q32P44	896 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ARID3A	Q99856	593 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	GMIP	Q9P107	970 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	PRR23A	A6NEV1	266 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TUB	P50607	506 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CCR3	P51677	355 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	NRL	P54845	237 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CETN1	Q12798	172 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	LRMP	Q12912	555 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CUL2	Q13617	745 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	NELL1	Q92832	810 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	P4HA2	O15460	535 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	NFATC1	O95644	943 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TBX18	O95935	607 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	DRD1	P21728	446 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	KIF11	P52732	1056 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721		Q6ZS52	159 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	LMO3	Q8TAP4	145 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	NACA2	Q9H009	215 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TLR5	O60602	858 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ATG13	O75143	517 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	EGF	P01133	1207 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TDGF1	P13385	188 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	SATB1	Q01826	763 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	DHCR24	Q15392	516 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	MLKL	Q8NB16	471 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CD101	Q93033	1021 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DMKN-222	ENST00000462721	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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