RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758		H7C0C1	242 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HAS3	O00219	553 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PIR	O00625	290 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TM9SF1	O15321	606 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO21	O94952	628 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	GJB6	O95452	261 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT15	P19012	456 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ARL4A	P40617	200 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP5O	P48047	213 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	BCAR1	P56945	870 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CDK16	Q00536	496 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	C9orf72	Q96LT7	481 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TWNK	Q96RR1	684 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CYTH2	Q99418	400 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	APBA2	Q99767	749 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SPC25	Q9HBM1	224 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SNTG2	Q9NY99	539 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CFAP73	A6NFT4	308 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP5H	O75947	161 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RECQL4	O94761	1208 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBED1	O96006	694 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	AKR1A1	P14550	325 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LRPAP1	P30533	357 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH3A1	P30838	453 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MSH2	P43246	934 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DPYSL3	Q14195	570 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX17	Q15036	470 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LLGL1	Q15334	1064 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TMED2	Q15363	201 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DPYSL2	Q16555	572 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC142	Q17RM4	750 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TRABD2A	Q86V40	505 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CCNJL	Q8IV13	435 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	C7orf31	Q8N865	590 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MCU	Q8NE86	351 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	UBA3	Q8TBC4	463 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FAF2	Q96CS3	445 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	EURL	Q9NYK6	297 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		12	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SKI	P12755	728 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CNTF	P26441	200 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	IL1R2	P27930	398 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FDFT1	P37268	417 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEA6	P43360	314 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LHX1	P48742	406 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB27A	P51159	221 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DYNLT1	P63172	113 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM17	P78536	824 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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