RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429190.2

NANOGP6-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP6, Length 847 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP6-201ENST00000429190 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 PSMD14O00487 310 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 JAK2O60674 1132 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 MFAP3LO75121 409 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 SCGB1D2O95969 90 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 FAM107AO95990 144 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 FESP07332 822 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 GSTA1P08263 222 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 PF4V1P10720 104 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 ATP1A3P13637 1013 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 ZNF18P17022 549 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 AKAP5P24588 427 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 ALDH1A3P47895 512 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 RPS6KA3P51812 740 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 RIPK1Q13546 671 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 PTGISQ16647 500 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 NAA35Q5VZE5 725 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 USP45Q70EL2 814 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 CEP57Q86XR8 500 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 XYLT1Q86Y38 959 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 TPH2Q8IWU9 490 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 D2HGDHQ8N465 521 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 TEX9Q8N6V9 391 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 TRIM58Q8NG06 486 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 CAGE1Q8TC20 777 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 JDP2Q8WYK2 163 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 KAT5Q92993 513 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 HPS3Q969F9 1004 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 CAVIN3Q969G5 261 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 COG3Q96JB2 828 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 SPAG5Q96R06 1193 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 DESI2Q9BSY9 194 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 FSD1Q9BTV5 496 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 CENPHQ9H3R5 247 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 NCDNQ9UBB6 729 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 LAMA4Q16363 1823 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 FMN2Q9NZ56 1722 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 NPATQ14207 1427 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 NEDD4P46934 1319 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 WDR17Q8IZU2 1322 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 SALL1Q9NSC2 1324 aa4.72□□□□□ -1.65
NANOGP6-201ENST00000429190 C3P01024 1663 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 MRC1P22897 1456 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 CARMIL3Q8ND23 1372 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 CFAP73A6NFT4 308 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 TMEM232C9JQI7 657 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 AGPSO00116 658 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 PDLIM1O00151 329 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 PJA2O43164 708 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 TSPAN6O43657 245 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 MGRN1O60291 552 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 FERP16591 822 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 SLC6A4P31645 630 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 PLCD1P51178 756 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 VAV2P52735 878 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 KRT83P78385 493 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 CDC42EP1Q00587 391 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 SPAG1Q07617 926 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 XRCC4Q13426 336 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 SPECC1Q5M775 1068 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 DACT2Q5SW24 774 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 ANO1Q5XXA6 986 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 AFMIDQ63HM1 303 aa4.71□□□□□ -1.66
NANOGP6-201ENST00000429190 NXNQ6DKJ4 435 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms