RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 TAB1Q15750 504 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ACAD11Q709F0 780 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NLRP14Q86W24 1093 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HASPINQ8TF76 798 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C18orf8Q96DM3 657 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ASIC4Q96FT7 647 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EPAS1Q99814 870 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PDCD10Q9BUL8 212 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZWILCHQ9H900 591 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM49BQ9NUQ9 324 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 AIPL1Q9NZN9 384 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF263O14978 683 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM24O15164 1050 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CYTH3O43739 400 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT37O76014 449 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CTDNEP1O95476 244 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 IRF1P10914 325 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MYL4P12829 197 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FGFR4P22455 802 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HMOX2P30519 316 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 VHLP40337 213 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFV1P49821 464 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CREMQ03060 361 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MYBPC2Q14324 1141 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ARID5BQ14865 1188 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BBS9Q3SYG4 887 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC153Q494R4 210 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EFHBQ8N7U6 833 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC26A7Q8TE54 656 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPH1Q92598 858 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CMTM5Q96DZ9 223 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNK16Q96T55 309 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FMO2Q99518 471 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RUSC1Q9BVN2 902 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SP110Q9HB58 689 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT84Q9NSB2 600 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SCN3BQ9NY72 215 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SNTG2Q9NY99 539 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LGALS16A8MUM7 142 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SGK1O00141 431 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 P4HA2O15460 535 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP3K13O43283 966 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADCY6O43306 1168 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CBFA2T3O75081 653 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SASH3O75995 380 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PDE9AO76083 593 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBED1O96006 694 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PAX3P23760 479 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BCAR1P56945 870 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PPARDQ03181 441 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EHHADHQ08426 723 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EPS8Q12929 822 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HIC1Q14526 733 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TBCCQ15814 346 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NTRK3Q16288 839 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PKN1Q16512 942 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC157Q569K6 752 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HIPK4Q8NE63 616 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SUN5Q8TC36 379 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF217Q8TC41 542 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 APBB2Q92870 758 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HPS1Q92902 700 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HPS3Q969F9 1004 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO32Q969P5 355 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms