RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 VSTM1Q6UX27 236 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 VPS52Q8N1B4 723 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CNPY3Q9BT09 278 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CARD9Q9H257 536 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RNF14Q9UBS8 474 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM66O15016 1216 aa21.48■■□□□ 1.03
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ATG4B-204ENST00000402096 FGF18O76093 207 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ZBED1O96006 694 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJB2P25686 324 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 OR1D2P34982 312 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CA8P35219 290 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DAOAP59103 153 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ATP11AP98196 1134 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DSG1Q02413 1049 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SMARCB1Q12824 385 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.48■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ADAM12O43184 909 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 MAGEA11P43364 429 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 GPR15P49685 360 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ROR1Q01973 937 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ACAP1Q15027 740 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DDR2Q16832 855 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC14Q49A88 953 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 LCHNA4D1U4 455 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DPYSL4O14531 572 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 LRCH4O75427 683 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DAB1O75553 588 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 TCF4P15884 667 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SLC5A3P53794 718 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 DEFB106AQ8N104 65 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA1Q92805 767 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 C8orf48Q96LL4 319 aa21.47■■□□□ 1.03
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ATG4B-204ENST00000402096 GBF1Q92538 1859 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 WDR27A2RRH5 827 aa21.46■■□□□ 1.03
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ATG4B-204ENST00000402096 ODF2Q5BJF6 829 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 AADACL2Q6P093 401 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ARCQ7LC44 396 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PLVAPQ9BX97 442 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 ZWILCHQ9H900 591 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-204ENST00000402096 CAPN9O14815 690 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 SOAT2O75908 522 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 GLI1P08151 1106 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 PYGMP11217 842 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 CTNNB1P35222 781 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 DUSP4Q13115 394 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 DCAF6Q58WW2 860 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 STKLD1Q8NE28 680 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 STK39Q9UEW8 545 aa21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.022e-8■■□□□ 13.7
ATG4B-204ENST00000402096 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 VNN2O95498 520 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 FGGP02679 453 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 LTFP02788 710 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 KRT1P04264 644 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 UQCRHP07919 91 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 LINC00271P0C7V0 271 aa21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-204ENST00000402096 MIPP30301 263 aa21.44■■□□□ 1.02
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