RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 PSMC3P17980 439 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 FANCCQ00597 558 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 RAB41Q5JT25 222 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 SNX30Q5VWJ9 437 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC186Q7Z3E2 898 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 SLC35F5Q8WV83 523 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 KIF9Q9HAQ2 790 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ACP6Q9NPH0 428 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 NLRC4Q9NPP4 1024 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 MUC3AQ02505 3323 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 C2orf78A6NCI8 922 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 HEPACAM2A8MVW5 462 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CLCN1P35523 988 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 KRT9P35527 623 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 PSEN1P49768 467 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TUBP50607 506 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TKTL1P51854 596 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 HECTD3Q5T447 861 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 MFSD6LQ8IWD5 586 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 YAF2Q8IY57 180 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CYP2S1Q96SQ9 504 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PQC6 194 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 UBASH3AP57075 661 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 NR1I3Q14994 352 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 SLC47A2Q86VL8 602 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGAP18Q8N392 663 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 HSFY1Q96LI6 401 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-204ENST00000400919 TULP2O00295 520 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 PRAMEF12O95522 483 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 ZBED1O96006 694 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 TPM3P06753 285 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 VITQ6UXI7 678 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 GPIHBP1Q8IV16 184 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 NACA2Q9H009 215 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 CEP83Q9Y592 693 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 EPHB6O15197 1021 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 OAS1P00973 400 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 SOX5P35711 763 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 STAT1P42224 750 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 GPD2P43304 727 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 PFKPQ01813 784 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 SIGLEC14Q08ET2 396 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 PMF1Q6P1K2 205 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 PCDHGC3Q9UN70 934 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 NARSO43776 548 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 CYP11B1P15538 503 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 JAM2P57087 298 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 ADIGQ0VDE8 80 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 DENND1BQ6P3S1 775 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 RNF214Q8ND24 703 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 BPIFB1Q8TDL5 484 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 STK32AQ8WU08 396 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 SLC22A12Q96S37 553 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 SMOC2Q9H3U7 446 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 EPHX3Q9H6B9 360 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 BRD9Q9H8M2 597 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 CNGB3Q9NQW8 809 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 NAGPAQ9UK23 515 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 FBXL21Q9UKT6 434 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 TLR5O60602 858 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 RALAP11233 206 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 ACADSBP45954 432 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 RGS7P49802 495 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 GPC5P78333 572 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 SLC7A9P82251 487 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 FCHO2Q0JRZ9 810 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 GRM2Q14416 872 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 PM20D1Q6GTS8 502 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM67Q6ZTA4 783 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 IRF7Q92985 503 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 NOX5Q96PH1 765 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 ULBP1Q9BZM6 244 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 LHX5Q9H2C1 402 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 ST7Q9NRC1 585 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 CCL26Q9Y258 94 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 MYO10Q9HD67 2058 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 GREB1Q4ZG55 1949 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PQH9 124 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF263O14978 683 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 GFPT2O94808 682 aa28.85■■■□□ 2.21
FAAP20-204ENST00000400919 OLFM2O95897 454 aa28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms