RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 CPA6Q8N4T0 437 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 ECT2Q9H8V3 914 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM92AA1XBS5 289 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 HHLA1C9JL84 531 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 LRMPQ12912 555 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 EML3Q32P44 896 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 HECTD3Q5T447 861 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP2A3Q93084 1043 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CHFRQ96EP1 664 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 IER2Q9BTL4 223 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 COCHO43405 550 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 AMPD2Q01433 879 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 TSSK4Q6SA08 328 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP16Q9BY84 665 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.38■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PRR23AA6NEV1 266 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PMM2O15305 246 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 GNA14O95837 355 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 GJA4P35212 333 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PGFP49763 221 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 TUBP50607 506 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CCINQ13939 588 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 GAS6Q14393 721 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 Q6ZS52 159 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP26A1O43174 497 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CETN1Q12798 172 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 NT5C1BQ96P26 610 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 NACA2Q9H009 215 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SCML2Q9UQR0 700 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 P4HA2O15460 535 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 NFATC1O95644 943 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CCR3P51677 355 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SATB1Q01826 763 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNH2Q12809 1159 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 NR1H3Q13133 447 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 TLR5O60602 858 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC192P0DO97 292 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CD19P15391 556 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CXCL12P48061 93 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 GALK1P51570 392 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF11P52732 1056 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 UBR7Q8N806 425 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 LMO3Q8TAP4 145 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 EGFP01133 1207 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP2R5DQ14738 602 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SGO2Q562F6 1265 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 MLKLQ8NB16 471 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.33■■□□□ 1.01
ANKRD39-201ENST00000393537 NELL1Q92832 810 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms