RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 PIGZQ86VD9 579 aa23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 SHDQ96IW2 340 aa23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP3Q9Y6I4 520 aa23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.24■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 F5P12259 2224 aa23.24■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 TULP2O00295 520 aa23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP26A1O43174 497 aa23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 COCHO43405 550 aa23.23■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 MFAP3P55082 362 aa23.23■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 CNGA2Q16280 664 aa23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAB41Q5JT25 222 aa23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 FOXQ1Q9C009 403 aa23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 GKN1Q9NS71 199 aa23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 OSER1Q9NX31 292 aa23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 HESX1Q9UBX0 185 aa23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 KANSL1LA0AUZ9 987 aa23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 BECN2A8MW95 431 aa23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 CD72P21854 359 aa23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNK2Q07912 1038 aa23.22■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 HECTD3Q5T447 861 aa23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBA3Q8TBC4 463 aa23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.22■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.22■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 STK25O00506 426 aa23.21■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC8A3P57103 927 aa23.21■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 SCD5Q86SK9 330 aa23.21■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 PJA1Q8NG27 643 aa23.21■■□□□ 1.31
IGHV3-20-201ENST00000390606 SHC3Q92529 594 aa23.21■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.21■■□□□ 1.31
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IGHV3-20-201ENST00000390606 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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IGHV3-20-201ENST00000390606 STILQ15468 1287 aa23.2■■□□□ 1.3
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IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.2■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 HELZP42694 1942 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 TLR5O60602 858 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARSAP15289 507 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 SOX9P48436 509 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTC8Q8TAM2 541 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 OSCP1Q8WVF1 389 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 OSBPL6Q9BZF3 934 aa23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-20-201ENST00000390606 VPS16Q9H269 839 aa23.19■■□□□ 1.3
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