RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 DIO1P49895 249 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 ADKP55263 362 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 XPR1Q9UBH6 696 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 TBX22Q9Y458 520 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 EVPLQ92817 2033 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 SERINC4A6NH21 518 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 HILS1P60008 231 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 KRT26Q7Z3Y9 468 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF329Q86UD4 541 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 ATL2Q8NHH9 583 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-202ENST00000367364 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 CLSPNQ9HAW4 1339 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-202ENST00000367364 DGKEP52429 567 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 KRT85P78386 507 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 B4GALNT1Q00973 533 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 ABCB5Q2M3G0 1257 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 NPNTQ6UXI9 565 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 MYBL2P10244 700 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 CNGA1P29973 690 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 ARRB2P32121 409 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 SOX8P57073 446 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP10-12P60413 245 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 STIM1Q13586 685 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 MLC1Q15049 377 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-202ENST00000367364 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 PNPOQ9NVS9 261 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-202ENST00000367364 EPN2O95208 641 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 CPA2P48052 419 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 MAP2K6P52564 334 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 HSF1Q00613 529 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 KCNB1Q14721 858 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 ODF1Q14990 250 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-202ENST00000367364 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-202ENST00000367364 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 PGGT1BP53609 377 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 UCP3P55916 312 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 MIB2Q96AX9 1013 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 FAM167AQ96KS9 214 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 GRID2O43424 1007 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 HOXB2P14652 356 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 PLS1Q14651 629 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 VSTM1Q6UX27 236 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 M0R3H8 397 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 PSMD9O00233 223 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 ACOT8O14734 319 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-202ENST00000367364 SPRY2O43597 315 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-202ENST00000367364 SATB1Q01826 763 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-202ENST00000367364 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-202ENST00000367364 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 TMX2Q9Y320 296 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-202ENST00000367364 NDUFB8O95169 186 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 CYP2C9P11712 490 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 PDCP20941 246 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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