RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 SDE2Q6IQ49 451 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 HOMEZQ8IX15 550 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 FAM162AQ96A26 154 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA5Q96PV4 448 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 IDI2Q9BXS1 227 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 MTFR1LQ9H019 292 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 NCAM2O15394 837 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 DGKIO75912 1065 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 INSRRP14616 1297 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CNTFP26441 200 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 GCNT1Q02742 428 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 KPNA6O60684 536 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 OAZ1P54368 228 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 OVGP1Q12889 678 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL11O14625 94 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLITRK3O94933 977 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 JCHAINP01591 159 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CKMP06732 381 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 BFSP2Q13515 415 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TUBGCP3Q96CW5 907 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CPB2Q96IY4 423 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TBCBQ99426 244 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 OSMRQ99650 979 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ASB7Q9H672 318 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 HEY2Q9UBP5 337 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 EPHX2P34913 555 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZPBP2Q6X784 338 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35C1Q96A29 364 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 PAFAH2Q99487 392 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB18Q96M61 343 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ECSITQ9BQ95 431 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 INTS13Q9NVM9 706 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 FAM86B1E9PN63 330 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 PTENP60484 403 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CHST12Q9NRB3 414 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM66O15016 1216 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ARIH2O95376 493 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ARL4DP49703 201 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 OXCT1P55809 520 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 BHMTQ93088 406 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SPASTQ9UBP0 616 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TNS2Q63HR2 1409 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CYGBQ8WWM9 190 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TATDN2Q93075 761 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR8Q96EF0 704 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHA8Q96JA3 519 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 RAP1GAPP47736 663 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF280DQ6N043 979 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SLC5A5Q92911 643 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SOX13Q9UN79 622 aa20.94■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NWD1Q149M9 1564 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 STRNO43815 780 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 THRAP10827 490 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 KCNA3P22001 575 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ACOT9Q9Y305 439 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT2P50583 147 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.93■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K7CLP57077 242 aa20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms