RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 IRGQQ8WZA9 623 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TLR10Q9BXR5 811 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 MSRAQ9UJ68 235 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 FANCGO15287 622 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 LPXNO60711 386 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ATF2P15336 505 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 PDGFRAP16234 1089 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 PSMA2P25787 234 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ELF1P32519 619 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 DDR2Q16832 855 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLGA1Q92805 767 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SPATA17Q96L03 361 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 USP3Q9Y6I4 520 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TNFRSF10BO14763 440 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 GRAP2O75791 330 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 VNN2O95498 520 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L7P0C7H9 530 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 GPD1P21695 349 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC5A3P53794 718 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 DAOAP59103 153 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ERVK-21P61565 698 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 RAB30Q15771 203 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 EMC1Q8N766 993 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 POF1BQ8WVV4 589 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 HES6Q96HZ4 224 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TCF25Q9BQ70 676 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CNPY3Q9BT09 278 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 COMMD8Q9NX08 183 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SNX12Q9UMY4 172 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 IRAK3Q9Y616 596 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TEX28O15482 410 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 NCK2O43639 380 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 RNF8O76064 485 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SDC4P31431 198 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TAF5Q15542 800 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TLR9Q9NR96 1032 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 USTQ9Y2C2 406 aa20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC66A2RUB6 948 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ADH1AP07327 375 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 OGDHQ02218 1023 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 PTPROQ16827 1216 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 EHD2Q9NZN4 543 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH10P35580 1976 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 DPYSL4O14531 572 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CAPN9O14815 690 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 FLT3P36888 993 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 MATKP42679 507 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ERVFC1P60507 584 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM2B-201ENST00000335523 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms