RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 DLDP09622 509 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
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HOXD1-201ENST00000331462 GPD1P21695 349 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ARFIP2P53365 341 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC6Q86X45 466 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 USP29Q9HBJ7 922 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 HEY2Q9UBP5 337 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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HOXD1-201ENST00000331462 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 M0QYV0 167 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 B4GALT5O43286 388 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 NFICP08651 508 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 KRT19P08727 400 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 USP6NLQ92738 828 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 BTBD10Q9BSF8 475 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 DCLRE1BQ9H816 532 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 MKS1Q9NXB0 559 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 BTBD7Q9P203 1132 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0G2JND7 137 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 CDH6P55285 790 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 OSTNP61366 133 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 MMRN1Q13201 1228 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TEX9Q8N6V9 391 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 MIS12Q9H081 205 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 PYGBP11216 843 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 GCKP35557 465 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINB4P48594 390 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 LY6KQ17RY6 165 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 NPNTQ6UXI9 565 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 KIRREL3Q8IZU9 778 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 NSL1Q96IY1 281 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 RNF157Q96PX1 679 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ARL8BQ9NVJ2 186 aa23.49■■□□□ 1.35
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HOXD1-201ENST00000331462 FZD9O00144 591 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TGM2P21980 687 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 PRKCHP24723 683 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 CCNFP41002 786 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 SLC26A2P50443 739 aa23.48■■□□□ 1.35
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HOXD1-201ENST00000331462 INCA1Q0VD86 236 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ORC1Q13415 861 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 MTM1Q13496 603 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 PDK2Q15119 407 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TRNP1Q6NT89 227 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM50Q86XT4 487 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM192Q8IY95 271 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 FAF2Q96CS3 445 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 DPYSL4O14531 572 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ARIH2O95376 493 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 GSTA2P09210 222 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 P4HA1P13674 534 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TTC8Q8TAM2 541 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TEKT4Q8WW24 435 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRFP10586 1907 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ENTPD5O75356 428 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ITGB3P05106 788 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 BGNP21810 368 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINB3P29508 390 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ABL2P42684 1182 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 FAM187BQ17R55 369 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM42Q8IWZ5 723 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 PLD5Q8N7P1 536 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 RXFP2Q8WXD0 754 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC39Q96DD0 335 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP4Q96MN2 994 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD1-201ENST00000331462 ASB7Q9H672 318 aa23.47■■□□□ 1.35
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