RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 SOAT2O75908 522 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 GJB6O95452 261 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 ZBED1O96006 694 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 IRS1P35568 1242 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 EFHC1Q5JVL4 640 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC26A9Q7LBE3 791 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 TCEAL8Q8IYN2 117 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 SCML4Q8N228 414 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM191CA6NGB0 347 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 MYO1FO00160 1098 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 PRRG1O14668 218 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 TGM5O43548 720 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 PALMO75781 387 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 USP17L7P0C7H9 530 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 ALDH1A3P47895 512 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 DAOAP59103 153 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 PM20D1Q6GTS8 502 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 LILRA6Q6PI73 481 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 SYCE1Q8N0S2 351 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 IRGQQ8WZA9 623 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 FBXO44Q9H4M3 255 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 ASNSD1Q9NWL6 643 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 COMMD8Q9NX08 183 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM59LQ9UK28 342 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 YIPF1Q9Y548 306 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 A0A1W2PPC1 479 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 GLUD1P00367 558 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 C1RP00736 705 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 GLI1P08151 1106 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 ARCQ7LC44 396 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 DAAM2Q86T65 1068 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC35F6Q8N357 371 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 BTBD6Q96KE9 485 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIM7Q9C029 511 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 FBXW11Q9UKB1 542 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 PLXNA3P51805 1871 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 HSF2BPO75031 334 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 ATF6P18850 670 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 MESDQ14696 234 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 TAF5Q15542 800 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 JOSD2Q8TAC2 188 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 GPR152Q8TDT2 470 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 FNIP1Q8TF40 1166 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 IL37Q9NZH6 218 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 MYO7AQ13402 2215 aa25.2■■□□□ 1.63
CCDC71L-201ENST00000315965 GRAP2O75791 330 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 TNNT1P13805 278 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 CLCN4P51793 760 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC149Q6ZUS6 474 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 GIPC2Q8TF65 315 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 GOLGA1Q92805 767 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM149B1Q96BN6 582 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 EHD2Q9NZN4 543 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 SCML2Q9UQR0 700 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 INSL5Q9Y5Q6 135 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 YWHAQP27348 245 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 PLD1Q13393 1074 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 EMC1Q8N766 993 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 WDR24Q96S15 920 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 EPOPA6NHQ4 379 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 C2CD4BA6NLJ0 364 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC38A8A6NNN8 435 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 SPATA31D3P0C874 917 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 GPD1P21695 349 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 TWF1Q12792 350 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 VEPH1Q14D04 833 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC71L-201ENST00000315965 STKLD1Q8NE28 680 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms