RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 INCA1Q0VD86 236 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PRR23BQ6ZRT6 265 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 UNC93AQ86WB7 457 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 OVCA2Q8WZ82 227 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 FBXO32Q969P5 355 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 MED10Q9BTT4 135 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.19■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ATG13O75143 517 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PIK3CAP42336 1068 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SLC6A11P48066 632 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ADAM9Q13443 819 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PNOCQ13519 176 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 DHCR24Q15392 516 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 FBXO43Q4G163 708 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 C12orf40Q86WS4 652 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SEMA4DQ92854 862 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SMARCD1Q96GM5 515 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 KRT82Q9NSB4 513 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 GMIPQ9P107 970 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 RAB23Q9ULC3 237 aa16.18■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 KIF20AO95235 890 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 NFATC1O95644 943 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 P4HA1P13674 534 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 MAP3K7CLP57077 242 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ENPEPQ07075 957 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 NR1H3Q13133 447 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SYT13Q7L8C5 426 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PDZD8Q8NEN9 1154 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 GAB3Q8WWW8 586 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 HHIPQ96QV1 700 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 COMMD8Q9NX08 183 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 OSER1Q9NX31 292 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ATP8B3O60423 1300 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 E2F8A0AVK6 867 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 GREM1O60565 184 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PRCPP42785 496 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 DMC1Q14565 340 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 HECTD3Q5T447 861 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 KBTBD6Q86V97 674 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CAMKK1Q8N5S9 505 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SPATA20Q8TB22 786 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 USP33Q8TEY7 942 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 USP18Q9UMW8 372 aa16.16■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 A0A0A0MRY4 1105 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 LRP3O75074 770 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CILPO75339 1184 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 TBX18O95935 607 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 ADORA2BP29275 332 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 TUBP50607 506 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.15■□□□□ 0.18
CTSW-201ENST00000307886 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 AXIN1O15169 862 aa16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 GDF9O60383 454 aa16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 CLSTN1O94985 981 aa16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 KRT13P13646 458 aa16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 GTF2H1P32780 548 aa16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 SEC13P55735 322 aa16.14■□□□□ 0.17
CTSW-201ENST00000307886 LMNB2Q03252 620 aa16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms