RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.01□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.01□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 HOXA2O43364 376 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 DAB1O75553 588 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 GAS8O95995 478 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 KCNJ1P48048 391 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CDR1P51861 262 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CCL23P55773 120 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TSPY1Q01534 308 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 ADCY1Q08828 1119 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FAAP100Q0VG06 881 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 SNX1Q13596 522 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CCNG2Q16589 344 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 DUPD1Q68J44 220 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 KRT222Q8N1A0 295 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 OR10T2Q8NGX3 314 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 HSPH1Q92598 858 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FAM149B1Q96BN6 582 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CCDC114Q96M63 670 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TOX2Q96NM4 488 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FAM53CQ9NYF3 392 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 OGFRQ9NZT2 677 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 DNAJB4Q9UDY4 337 aa11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CXCL10P02778 98 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 GBP1P32455 592 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TKTL1P51854 596 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 KRT17Q04695 432 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TLE2Q04725 743 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 ADCY2Q08462 1091 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 PPP1R7Q15435 360 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TCTN1Q2MV58 587 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 RAB6CQ53S08 254 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FAM171BQ6P995 826 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 KCTD6Q8NC69 237 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 PKMYT1Q99640 499 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 SMOQ99835 787 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 RAB6CQ9H0N0 254 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 HPCAL4Q9UM19 191 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 PLXNA3P51805 1871 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TRAPPC3O43617 180 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FBXO21O94952 628 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FAM153BP0C7A2 387 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 KDELR1P24390 212 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 GATMP50440 423 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CACNA2D1P54289 1103 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TAZQ16635 292 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FAM153CQ494X1 144 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 NPAS4Q8IUM7 802 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 ZMIZ2Q8NF64 920 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TEKT4Q8WW24 435 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TBCBQ99426 244 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CALN1Q9BXU9 219 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FAM153AQ9UHL3 310 aa10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CD48P09326 243 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CYP2C18P33260 490 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 MATKP42679 507 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 DRG2P55039 364 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CDH6P55285 790 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 HDAC4P56524 1084 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 GPS2Q13227 327 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 PTK6Q13882 451 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 BBS12Q6ZW61 710 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 MREGQ8N565 214 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CASD1Q96PB1 797 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 TMEM209Q96SK2 561 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 KCNK16Q96T55 309 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 FAM118BQ9BPY3 351 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 ULBP1Q9BZM6 244 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa10.98□□□□□ -0.65
COPS2-201ENST00000299259 CNGB3Q9NQW8 809 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms