RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227451.3

DTX4-201, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DTX4, Length 5,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-201ENST00000227451 FAM131BQ86XD5 332 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 NMRK1Q9NWW6 199 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 H0Y3Z8 333 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 STARD3Q14849 445 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 FZD1Q9UP38 647 aa21.42■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 FKTNO75072 461 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 ARIH2O95376 493 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 BEX3Q00994 111 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 NAT9Q9BTE0 207 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 CHN1P15882 459 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 RHBDL3P58872 404 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 CFAP73A6NFT4 308 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 RETSATQ6NUM9 610 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 EXD1Q8NHP7 514 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TBX4P57082 545 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 ANO5Q75V66 913 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.41■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 LACTBL1A8MY62 500 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 OCM2P0CE71 109 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 RRM1P23921 792 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 YWHAQP27348 245 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 MAP2K5Q13163 448 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SERPINB11Q96P15 392 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 APBA2Q99767 749 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 LRRC40Q9H9A6 602 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 CBX4O00257 560 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TRIM66O15016 1216 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 PAEPP09466 180 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 MED21Q13503 144 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 UROC1Q96N76 676 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 MAP3K13O43283 966 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 HPCAP84074 193 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 HOMEZQ8IX15 550 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 PNMA5Q96PV4 448 aa21.4■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 KLHL2O95198 593 aa21.39■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 ATP6V1E1P36543 226 aa21.39■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.39■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 TMEM199Q8N511 208 aa21.39■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 ADAM2Q99965 735 aa21.39■■□□□ 1.02
DTX4-201ENST00000227451 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 GCNT1Q02742 428 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 SPACA6W5XKT8 324 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 RAP1GDS1P52306 607 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 MAPK7Q13164 816 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 CLPBQ9H078 707 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 MROH9Q5TGP6 573 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 C16orf89Q6UX73 402 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 TBCBQ99426 244 aa21.39■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 TIMM44O43615 452 aa21.38■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 C2CD6Q53TS8 623 aa21.38■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 FAXCQ5TGI0 409 aa21.38■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.38■■□□□ 1.01
DTX4-201ENST00000227451 PORCNQ9H237 461 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms