RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089245.6

Shq1-201, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-201ENSMUST00000089245 RtknQ8C6B2 564 aa20■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lrrc14Q8VC16 493 aa20■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rcan3Q9JKK0 239 aa20■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Btg3P50615 252 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lig3P97386 1015 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Bmp1P98063 991 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 NntQ61941 1086 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 CgasQ8C6L5 507 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Q8CDN1 933 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ints4Q8CIM8 964 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Acsf2Q8VCW8 615 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Bzw2Q91VK1 419 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ggt7Q99JP7 662 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cox16Q9CR63 106 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Trim10Q9WUH5 489 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa19.99■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 GmlE9PX31 176 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr1022L7MTT3 315 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cdk14O35495 469 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 RaxO35602 342 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tpp1O89023 562 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 LdhcP00342 332 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tcf3P15806 651 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Taf3Q5HZG4 932 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tbx2Q60707 711 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Runx3Q64131 409 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Q8BHR8 331 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 CptpQ8BS40 216 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tgif2Q8C0Y1 237 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Robo4Q8C310 1012 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ipo4Q8VI75 1082 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tc2nQ91XT6 489 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sertad2Q9JJG5 309 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Znf106O88466 1888 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lcn6A2AJB9 181 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lrrc63A6H694 637 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cdh18E9Q9Q6 790 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Man2b1O09159 1013 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gpr3P35413 330 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ovgp1Q62010 721 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Aldh1a2Q62148 518 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Prss50Q8BLH5 439 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 LarsQ8BMJ2 1178 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gpr153Q8K0Z9 631 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp566Q8VCI1 386 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Barhl2Q8VIB5 384 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ppa2Q91VM9 330 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 AjubaQ91XC0 547 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mfap3lQ9D3X9 409 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cul2Q9D4H8 745 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 IkbkeQ9R0T8 717 aa19.98■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rev3lQ61493 3122 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup10A2BIN1 180 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup14A2CEK7 180 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup19A9C497 187 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup15A9R9W0 180 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup17B5X0G2 180 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup8E9PVW0 235 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup7E9QA79 235 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sypl2O89104 264 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup6P02762 180 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp1P08042 402 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup1P11588 180 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mup2P11589 180 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 NsfP46460 744 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zhx1P70121 873 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rasa4Q6PFQ7 802 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Fbxo9Q8BK06 437 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dclk3Q8BWQ5 790 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lman2Q9DBH5 358 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 PolhQ9JJN0 694 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 St6galnac4Q9R2B6 360 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cpxm1Q9Z100 722 aa19.97■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Atp2c2A7L9Z8 944 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 ByslO54825 436 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Myl4P09541 193 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 YwhagP61982 247 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Hrh2P97292 397 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Stt3bQ3TDQ1 823 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tbc1d1Q60949 1255 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tmx4Q8C0L0 335 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 BbxQ8VBW5 907 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lysmd3Q99LE3 305 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Egfl6Q9JJZ5 550 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dnajc7Q9QYI3 494 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sema4fQ9Z123 777 aa19.96■□□□□ 0.79
Shq1-201ENSMUST00000089245 SpaarA0A1B0GSZ0 75 aa19.95■□□□□ 0.78
Shq1-201ENSMUST00000089245 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa19.95■□□□□ 0.78
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dcpp2E9PYC2 171 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.9 ms