RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W POP7P38291 140 aa6.66□□□□□ -1.34
BRR1YPR057W YMR175W-AQ3E766 64 aa6.66□□□□□ -1.34
BRR1YPR057W YAL065CO13511 128 aa6.65□□□□□ -1.34
BRR1YPR057W RPC10P40422 70 aa6.65□□□□□ -1.34
BRR1YPR057W CWP2P43497 92 aa6.65□□□□□ -1.34
BRR1YPR057W RPR2P40571 144 aa6.64□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W YDR115WQ04598 105 aa6.64□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W PBA1Q05778 276 aa6.64□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W ISU2Q12056 156 aa6.64□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W DIF1O13577 133 aa6.63□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W CDC43P18898 376 aa6.63□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W RTC6O14464 93 aa6.62□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W HYP2P23301 157 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W YDL241WQ07738 123 aa6.62□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W CPR1P14832 162 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W ANB1P19211 157 aa6.6□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W SVP26P38869 228 aa6.6□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W UBC11P52492 156 aa6.6□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W YHR130CP38834 111 aa6.59□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W YAL064WP39711 94 aa6.59□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W YIA6P40556 373 aa6.59□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W YLL006W-AQ3E814 58 aa6.59□□□□□ -1.35
BRR1YPR057W RGM1Q00453 211 aa6.58□□□□□ -1.36
BRR1YPR057W MET32Q12041 191 aa6.58□□□□□ -1.36
BRR1YPR057W RRT15Q3E811 62 aa6.57□□□□□ -1.36
BRR1YPR057W YOR020W-AQ3E824 90 aa6.56□□□□□ -1.36
BRR1YPR057W EOS1P53938 366 aa6.55□□□□□ -1.36
BRR1YPR057W HPA2Q06592 156 aa6.54□□□□□ -1.36
BRR1YPR057W ARO2P28777 376 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
BRR1YPR057W ABF2Q02486 183 aa6.53□□□□□ -1.36
BRR1YPR057W AQY2P0CD90 149 aa6.52□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W MVB12P42939 101 aa6.52□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W YAR023CD6VPM8 179 aa6.51□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W COX10P21592 462 aa6.51□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data6.51□□□□□ -1.37not detected
BRR1YPR057W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W DUT1P33317 147 aa6.5□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W KNH1P50112 268 aa6.49□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W YFL019CP43576 117 aa6.48□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W HUR1P45820 110 aa6.48□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W YPL229WQ99395 206 aa6.48□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W YBL039W-BP0C268 59 aa6.47□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W IRC21Q04772 201 aa6.47□□□□□ -1.37
BRR1YPR057W STF1P01098 86 aa6.46□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W AIM19P40502 157 aa6.46□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W SNA2P56508 79 aa6.45□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W ICY1Q04329 127 aa6.45□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W YOR034C-AQ3E735 80 aa6.45□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W YLR236CA0A023PZG4 107 aa6.43□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W UBC4P15731 148 aa6.42□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W IGD1P43598 195 aa6.42□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W YPR195CQ06594 109 aa6.42□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa6.42□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W DSE2P38844 325 aa6.41□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W YDR029WQ12111 104 aa6.4□□□□□ -1.38
BRR1YPR057W RPA12P32529 125 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W MSA2P36157 363 aa6.39□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W OST2P46964 130 aa6.38□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W YGL041C-BQ3E750 60 aa6.38□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W Q0032Q9ZZX7 96 aa6.38□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W MRP10O75012 95 aa6.37□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W SMP1P38128 452 aa6.37□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W YPL257WQ08974 193 aa6.37□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W YLR307C-AQ3E825 87 aa6.37□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W ECM12O13529 151 aa6.35□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W YDR034C-AP0C289 58 aa6.35□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W ATX1P38636 73 aa6.35□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W PEX22P39718 180 aa6.35□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W MPC3P53311 146 aa6.34□□□□□ -1.39
BRR1YPR057W SLO1Q3E784 85 aa6.33□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W YBR230W-AQ3E762 66 aa6.32□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W YJR107C-AP0CT86 78 aa6.31□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W FYV5P25585 152 aa6.31□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W RUB1Q03919 77 aa6.31□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W YJL127C-BQ3E828 52 aa6.31□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W YCR085WP25650 117 aa6.3□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa6.3□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W YGL193CP53097 103 aa6.29□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W INO4P13902 151 aa6.28□□□□□ -1.4
BRR1YPR057W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa6.26□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W SFT1P43682 97 aa6.25□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W ATP18P81450 59 aa6.25□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W YLR156WP0CE96 114 aa6.23□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W YLR159WP0CE97 114 aa6.23□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W YLR161WP0CE98 114 aa6.23□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W LCL2Q08045 131 aa6.23□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W TSC3Q3E790 80 aa6.23□□□□□ -1.41
BRR1YPR057W YER039C-AP0CD97 72 aa6.22□□□□□ -1.41
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