RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.37	□□□□□ -1.71	not detected
YCK1	YHR135C	QCR8	P08525	94 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	COX14	P39103	70 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	YAR029W	P39549	74 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	PPT2	Q12036	173 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	ENV10	Q99382	181 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YCK1	YHR135C	TOA2	P32774	122 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YAL065C	O13511	128 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	ANB1	P19211	157 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	POP7	P38291	140 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YAL064W	P39711	94 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	ERG28	P40030	148 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	CWP2	P43497	92 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	EOS1	P53938	366 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	SVP26	P38869	228 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	PBA1	Q05778	276 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	RPR2	P40571	144 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	SPC1	P46965	94 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	RPC10	P40422	70 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YIA6	P40556	373 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YHR130C	P38834	111 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	RGM1	Q00453	211 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YCK1	YHR135C	RTC6	O14464	93 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	HPA2	Q06592	156 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	HOT13	P36078	116 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	DSE2	P38844	325 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	YDL241W	Q07738	123 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	MVB12	P42939	101 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	HUR1	P45820	110 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	AQY2	P0CD90	149 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	COX10	P21592	462 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	ABF2	Q02486	183 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	KNH1	P50112	268 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	RUB1	Q03919	77 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	IRC21	Q04772	201 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	YFL019C	P43576	117 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	OST2	P46964	130 aa		4.21	□□□□□ -1.73
YCK1	YHR135C	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	IGD1	P43598	195 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	SNA2	P56508	79 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	AIM19	P40502	157 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	ICY1	Q04329	127 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	SMP1	P38128	452 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	ATX1	P38636	73 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	MPC3	P53311	146 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	INO4	P13902	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	STF1	P01098	86 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	UBC4	P15731	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	MSA2	P36157	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	YDR029W	Q12111	104 aa		4.15	□□□□□ -1.74
YCK1	YHR135C	PEX22	P39718	180 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	ECM12	O13529	151 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	FYV5	P25585	152 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YCR085W	P25650	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	ATP18	P81450	59 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YCK1	YHR135C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.09	□□□□□ -1.76

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