RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	YBR032W	P38223	100 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YGR017W	P53210	297 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	LCL1	Q02786	101 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	SGF11	Q03067	99 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.04	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	FPR2	P32472	135 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	SNF11	P38956	169 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	SPI1	P40092	148 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	IMP2	P46972	177 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YGL204C	P53089	101 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	TOM7	P53507	60 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.03	□□□□□ -2.4
RSM27	YGR215W	FKS3	Q04952	1785 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ECM29	P38737	1868 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	COX9	P07255	59 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	UBC4	P15731	148 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YCR101C	P25607	182 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	HYM1	P32464	399 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU2	P32612	120 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	RPC10	P40422	70 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAM16	P42949	149 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SPC1	P46965	94 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU12	P53343	120 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ELC1	Q03071	99 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	TVP18	Q04767	167 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	HKR1	P41809	1802 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YAL065C	O13511	128 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	UBC5	P15732	148 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU3	P25610	124 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	MRP49	P32388	137 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU24	P38155	120 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YBL071C	P38185	102 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YHR173C	P38864	112 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	AIM19	P40502	157 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU15	P40585	124 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YGR042W	P53227	271 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	DYN2	Q02647	92 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	COA2	Q3E823	68 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ECM12	O13529	151 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SEC59	P20048	519 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU16	P35994	123 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YBR016W	P38216	128 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YBR090C	P38253	122 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YHL005C	P38752	130 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SWM2	P40342	146 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	EMC5	P40540	141 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SNA2	P56508	79 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YMR082C	Q04276	118 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SPC2	Q04969	178 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	FRQ1	Q06389	190 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SCP1	Q08873	200 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YLR118C	Q12354	227 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ENV10	Q99382	181 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YLR255C	O13574	117 aa		-0.01	□□□□□ -2.41

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