RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-1

RDN25-1, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-1, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-1RDN25-1 YOL160WQ08321 113 aa7.46□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 EDC1P53080 175 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 YOL085CQ99345 113 aa7.45□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 YGL260WP53056 76 aa7.44□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 MGR2Q02889 113 aa7.44□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 RPL15AP05748 204 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 UBC4P15731 148 aa7.43□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 LDB16P25587 256 aa7.43□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 GLO1P50107 326 aa7.43□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 DIF1O13577 133 aa7.42□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 TDA8Q6B2U8 126 aa7.42□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 GCN1P33892 2672 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 HUR1P45820 110 aa7.41□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 ERI1P62651 68 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 YLR156WP0CE96 114 aa7.4□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 YLR159WP0CE97 114 aa7.4□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 YLR161WP0CE98 114 aa7.4□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 MPC2P38857 129 aa7.4□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 KRE9P39005 276 aa7.4□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 SHH4Q06236 168 aa7.4□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 PPT2Q12036 173 aa7.4□□□□□ -1.22
RDN25-1RDN25-1 SPS100P13130 326 aa7.39□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 AIM4P38305 123 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YGR164WP53291 111 aa7.39□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YLR342W-AQ3E810 57 aa7.39□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YMR295CQ03559 197 aa7.38□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 RPL16AP26784 199 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YHL037CP38733 133 aa7.37□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YDR246W-AQ3E763 66 aa7.37□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 PRP8P33334 2413 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 DCV1P43595 202 aa7.37□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 ICS3P47034 131 aa7.37□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YNL046WP53956 172 aa7.36□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YOR008C-AQ3E7B9 74 aa7.36□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 TOS6P48560 102 aa7.35□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 SPI1P40092 148 aa7.34□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YOR381W-AQ3E804 55 aa7.34□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 ATP20Q12233 115 aa7.34□□□□□ -1.23
RDN25-1RDN25-1 YGL088WP53151 121 aa7.33□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 SPT4P32914 102 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 COX17Q12287 69 aa7.33□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 POR2P40478 281 aa7.32□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 GAT4P40569 121 aa7.32□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 YHR022CP38763 256 aa7.32□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 MRPS12P53732 153 aa7.32□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 YOR011W-AQ3E807 68 aa7.32□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 RPL38P49167 78 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 MIG3P39943 394 aa7.3□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 YDR274CP87283 123 aa7.29□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 TEL1P38110 2787 aa7.28□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 RPL26AP05743 127 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 URM1P40554 99 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 RPL26BP53221 127 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RDN25-1RDN25-1 MSA2P36157 363 aa7.27□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 IRC21Q04772 201 aa7.27□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 YPR013CQ12145 317 aa7.27□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 SHU1P38751 150 aa7.25□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 RSM18P40033 138 aa7.25□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 TOS8P53147 276 aa7.23□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 YBR200W-AQ3E755 54 aa7.23□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 YBR056W-AI2HB52 66 aa7.22□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 YER135CP40082 130 aa7.22□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 TDA2P40045 126 aa7.21□□□□□ -1.25
RDN25-1RDN25-1 YJR107C-AP0CT86 78 aa7.21□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 RPB9P27999 122 aa7.2□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 HOT13P36078 116 aa7.19□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data7.19□□□□□ -1.26not detected
RDN25-1RDN25-1 YFR035CP43608 114 aa7.19□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 YHL005CP38752 130 aa7.18□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 CCW14O13547 238 aa7.18□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 PEX17P40155 199 aa7.18□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 YIR020CP40575 100 aa7.18□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 RTG1P32607 177 aa7.17□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 YJR146WP47174 117 aa7.17□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 SRL1Q08673 210 aa7.17□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 CRC1Q12289 327 aa7.17□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 YGR121W-AQ3E816 71 aa7.17□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 MEC1P38111 2368 aa7.16□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 YAL064WP39711 94 aa7.16□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 YMR122CQ03879 124 aa7.15□□□□□ -1.26
RDN25-1RDN25-1 RGM1Q00453 211 aa7.15□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 YLR162WQ06235 118 aa7.15□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 SPO24Q3E752 67 aa7.15□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 YAL065CO13511 128 aa7.14□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 MPC3P53311 146 aa7.12□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 OST5Q92316 86 aa7.12□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 SAP30P38429 201 aa7.12□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 YBR126W-AQ8TGU7 68 aa7.12□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 YEL008WP40001 126 aa7.11□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 SPG4Q04438 115 aa7.11□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 YPL278CQ08990 100 aa7.11□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 YOR314WQ12506 109 aa7.11□□□□□ -1.27
RDN25-1RDN25-1 YPR153WQ06537 140 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 139.8 ms