RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 SGSM3Q96HU1 749 aa7.11□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF570Q96NI8 536 aa7.11□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 TSGA13Q96PP4 275 aa7.11□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 ACAD9Q9H845 621 aa7.11□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.11□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.11□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 WASH4PA8MWX3 477 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 C10orf142B7Z368 130 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC172P0C7W6 258 aa7.1□□□□□ -1.27
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PCAT5-201ENST00000626667 GNGT1P63211 74 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 PEX26Q7Z412 305 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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PCAT5-201ENST00000626667 RMDN3Q96TC7 470 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CDT1Q9H211 546 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 A6NJR5 290 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 APOC2P02655 101 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CYP11A1P05108 521 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 HDAC4P56524 1084 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CAP1Q01518 475 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 ACVR1Q04771 509 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 PTK2BQ14289 1009 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 TTC30AQ86WT1 665 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 NRG4Q8WWG1 115 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 C7orf26Q96N11 449 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 ASB7Q9H672 318 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 TOMM22Q9NS69 142 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 RNF223E7ERA6 249 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 K7ENM7 598 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 UNC5CO95185 931 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 F2P00734 622 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 EFNA5P52803 228 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 MTERF2Q49AM1 385 aa7.1□□□□□ -1.27
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PCAT5-201ENST00000626667 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.1□□□□□ -1.27
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PCAT5-201ENST00000626667 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 RNF146Q9NTX7 359 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.1□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC189A1A4V9 331 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 E5RJQ4 531 aa7.09□□□□□ -1.27
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PCAT5-201ENST00000626667 OGTO15294 1046 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 MLNP12872 115 aa7.09□□□□□ -1.27
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PCAT5-201ENST00000626667 TNIP1Q15025 636 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 MAPK6Q16659 721 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 P3H1Q32P28 736 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 SH2D4BQ5SQS7 431 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CFAP58Q5T655 872 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CNDP1Q96KN2 507 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 NLRP4Q96MN2 994 aa7.09□□□□□ -1.27
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PCAT5-201ENST00000626667 ATP6V1G2O95670 118 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 IGLV3-27P01718 113 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 CD48P09326 243 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 SLC1A5Q15758 541 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.09□□□□□ -1.27
PCAT5-201ENST00000626667 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.09□□□□□ -1.27
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