RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLK5Q496M5 336 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANTXRLA6NF34 631 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 K7EQS6 105 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 EXOC3O60645 756 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 F13A1P00488 732 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP17A1P05093 508 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATICP31939 592 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ME1P48163 572 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEC13P55735 322 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 RESP18Q5W5W9 173 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNX21Q969T3 373 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 EBF1Q9UH73 591 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACACBO00763 2458 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCLK1O15075 740 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 MPLP40238 635 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 LIMK1P53667 647 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP33Q8TEY7 942 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 PHACTR2O75167 634 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 DGKEP52429 567 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDH8P55286 799 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 BIRC3Q13489 604 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 C2orf27AQ580R0 203 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL31Q6EBC2 164 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 NUP93Q8N1F7 819 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 KLRC4O43908 158 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNA4P22459 653 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 DHCR24Q15392 516 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF699Q32M78 642 aa22.08■■□□□ 1.13
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TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNK16Q96T55 309 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-208ENST00000616074 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 NUP205Q92621 2012 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLSTN1O94985 981 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 YWHAQP27348 245 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC6A11P48066 632 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 MESP2Q0VG99 397 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 STK4Q13043 487 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 PKP1Q13835 747 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 ELF2Q15723 593 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM35AQ86V20 835 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCEAL3Q969E4 200 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXO32Q969P5 355 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 SDCBP2Q9H190 292 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 VPS45Q9NRW7 570 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 INVSQ9Y283 1065 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 TM4SF5O14894 197 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 RHOBTB1O94844 696 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 VNN1O95497 513 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLDN10P78369 228 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 NCOA4Q13772 614 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-208ENST00000616074 STPG1Q5TH74 334 aa22.06■■□□□ 1.12
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